项目目标设计是指在项目构思的基础上，进行项目基本目标策划，并对项目构成、项目过程、项目环境进行深入分析，结合项目主体自身状况提出目标，建立目标系统。
主体利益调节问题，即使项目目标能照顾到项目主体各方的基本利益。项目的目标是通过对问题的解决而更佳地满足上层系统各方面对项目的需要，所以许多目标因素，特别是系统目标是由许多方面提出来的，目标系统设计必须照顾到所有各方的基本利益。主体利益调节的原则是既要符合总目标，又要照顾到各方面的基本利益。所以说，项目的目标系统经常是用来维持项目组织和上层系统组织之间的利益平衡，防止部门干预目标设计，同时防止部门冲突而导致项目目标因素的冲突。
当项目目标由业主定义时，目标常常是随意定义的或带估计性质的，可能存在目标要求不清楚、交错、矛盾等情况，此时应由项目策划者进行认真研究并定界。
应以工作小组的形式进行目标设计的组织和管理，发挥集体智慧。在目标设计阶段，尽管尚无项目管理小组和项目经理，但鉴于目标设计工作的专业性，引入工作小组形式是必要的。对于大型项目，还应在成立广泛代表性的工作小组基础上，吸引上层系统或其他子系统人员参与，形成一个外部圈子。工作小组通常包括目标设计的组织和管理人员、市场分析人员、项目相关技术和产品开发人员及一般的情况分析人员等。外部圈子主要应包括法律专家、财务专家、营销专家、战略设计人员及各类后勤管理人员等。
不应过早地与项目实施方案联系，保证对项目目标的充分论证。目标设计最终要提出对目标设计的基本介绍，但在前期策划阶段，目标设计的介绍不是精细的描述，真正详细的设计和完全可操作性的目标管理系统是在可行性研究之后，通过技术设计和计划来完成的。在目标设计阶段，若目标过早地和方案联系，不仅会影响对目标的充分论证，也可能会抛弃更为合适的解决方案。
